Thời gian qua, UBND tỉnh Phú Yên cũng đã chỉ đạo các sở, ban, ngành và địa phương tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra công tác quản lý nhà nước về khoáng sản, hoạt động khoáng sản của các tổ chức, cá nhân trên địa bàn tỉnh. Kết quả thanh tra, kiểm tra cho thấy công tác quản lý, cấp phép hoạt động khoáng sản của tỉnh đã đạt được nhiều kết quả quan trọng, góp phần nâng cao hiệu lực công tác quản lý nhà nước, hiệu quả sử dụng tài nguyên, tạo việc làm và thu nhận cho người lao động; tình trạng khai thác khoáng sản trái phép cơ bản được ngăn chặn kịp thời, trật tự an ninh trong hoạt động khoáng sản được ổn định,…
Nhằm nâng cao hiệu lực, hiệu quả công tác quản lý nhà nước về khoáng sản, UBND tỉnh Phú Yên giao Sở Tài nguyên và Môi trường (TN&MT) chủ trì, phối hợp các sở, ngành rà soát tính pháp lý của các dự án đầu tư xây dựng công trình có thu hồi khoáng sản; chỉ tham mưu UBND tỉnh cấp phép khai thác thu hồi khoáng sản trong khu vực dự án đầu tư xây dựng công trình sau khi được Bộ TN&MT kiểm tra, chấp thuận bằng văn bản.
Đồng thời, kiểm tra, rà soát tình hình cấp phép thăm dò, khai thác đối với các khu vực khoáng sản đã được khoanh định, công bố là khu vực khoáng sản phân tán nhỏ lẻ. Tham mưu UBND tỉnh dừng khai thác, đóng cửa mỏ, cải tạo phục hồi môi trường những khu vực khai thác không hiệu quả, gây ô nhiễm môi trường, mất trật tự an ninh. Chỉ tham mưu, đề xuất UBND tỉnh đề nghị Bộ TN&MT khoanh định, công bố là khu vực có khoáng sản phân tán nhỏ lẻ đối với các khu vực đáp ứng tiêu chí theo quy định.
Ngoài ra, nhằm nâng cao chất lượng thẩm định đánh giá tác động môi trường, UBND tỉnh Phú Yên yêu cầu Sở TN&MT nâng cao chất lượng thẩm định báo cáo đánh giá tác động môi trường, phương án cải tạo phục hồi môi trường. Tăng cường công tác kiểm tra, giám sát đối với công tác cải tạo, phục hồi môi trường trong khai thác, chế biến khoáng sản. Rà soát, kiểm tra công tác đóng cửa mỏ đối với các Giấy phép khai thác khoáng sản đã hết hiệu lực. Bên cạnh đó, yêu cầu tổ chức, cá nhân phải thực hiện đầy đủ các nghĩa vụ, trách nhiệm trong khai thác khoáng sản, đặc biệt là nghĩa vụ tài chính, nghĩa vụ kiểm kê trữ lượng khoáng sản trước khi thực hiện công tác đóng cửa mỏ. Đánh giá chi tiết các tác động môi trường do dự án gây ra, từ đó đề xuất các giải pháp giảm thiểu tác động tiêu cực, đồng thời nâng cao trách nhiệm của chủ dự án trong việc thực hiện các biện pháp bảo vệ môi trường trong quá trình khai thác khoáng sản.
Giao Sở Xây dựng chủ trì, phối hợp các sở, ngành và địa phương rà soát, đánh giá lại việc thực hiện các quy hoạch khoáng sản đã ban hành để kịp thời tham mưu UBND tỉnh bổ sung quy hoạch để đảm bảo phù hợp với tình hình thực tế của địa phương, phù hợp với đặc điểm của từng loại khoáng sản; mang tính định hướng và đảm bảo sử dụng hợp lý, tiết kiệm, hiệu quả khoáng sản. Chỉ đưa vào Quy hoạch các khu vực thuộc thẩm quyền cấp phép của tỉnh. Trước khi trình UBND tỉnh phê duyệt hoặc điều chỉnh, bổ sung quy hoạch phải tham mưu UBND tỉnh lấy ý kiến của các Bộ:TN&MT, Công Thương, Xây dựng theo quy định. Không đưa vào Quy hoạch khoáng sản đối với những khu vực là rừng tự nhiên.
Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn không tham mưu UBND tỉnh chuyển đổi rừng tự nhiên sang hoạt động khoáng sản theo nội dung Chỉ thị số 13-CT/TW ngày 12/01/2017 của Ban Bí thư về tăng cường sự lãnh đạo của Đảng đối với công tác quản lý, bảo vệ và phát triển rừng.
UBND tỉnh Phú Yên yêu cầu các sở, ngành và địa phương tiếp tục triển khai thực hiện tốt Chỉ thị của Thủ tướng Chính phủ về tăng cường hiệu lực thực thi chính sách, pháp luật về khoáng sản và Quyết định của UBND tỉnh về ban hành Quy chế quản lý, bảo vệ khoáng sản và quản lý hoạt động khoáng sản trên địa bàn tỉnh. Thực hiện nghiêm phương án bảo vệ khoáng sản chưa khai thác trên địa bàn quản lý; nâng cao trách nhiệm, thực hiện tốt chức năng trong công tác quản lý, bảo vệ khoáng sản trên địa bàn theo thẩm quyền; tăng cường kiểm tra, giám sát việc quản lý, sử dụng khoáng sản trên địa bàn, chỉ đạo các cơ quan chuyên môn ngăn chặn, giải tỏa hoạt động khai thác khoáng sản trái phép ngay sau khi phát hiện hoặc được báo tin xảy ra trên địa bàn. Xử lý nghiêm các trường hợp vi phạm.