Đoàn kiểm tra liên ngành sẽ tiến hành kiểm tra, rà soát, báo cáo cụ thể tình hình, số lượng lồng cá đang được nuôi trên hồ Thác Bà. Từ đó đối chiếu với Đề án phát triển nuôi trồng thủy sản tỉnh Yên Bái, giai đoạn 2016-2020 được phê duyệt kèm theo Quyết định số 112/QĐ-UBND của Chủ tịch UBND tỉnh Yên Bái. Đồng thời lập danh sách các tổ chức, hộ gia đình, cá nhân đang có hoạt động nuôi cá lồng trái phép trên hồ Thác Bà.
Qua kiểm tra, sẽ căn cứ vào tính chất, mức độ vi phạm, các quy định pháp luật có liên quan và tình hình thực tế tại địa phương để xử lý hoặc kiến nghị cấp có thẩm quyền xem xét, xử lý nghiêm các tổ chức, hộ gia đình, cá nhân vi phạm, tự ý nuôi cá lồng trên hồ Thác Bà khi chưa được các cơ quan có thẩm quyền cho phép.
Đồng thời, phải tổng hợp báo cáo đánh giá, làm rõ thực trạng tình hình, mức độ vi phạm và nguyên nhân, nhất là nguyên nhân chủ quan. Qua đó, đề xuất giải pháp có hiệu quả ngăn chặn, chấm dứt tình trạng vi phạm nuôi cá lồng trái phép trên hồ Thác Bà.