Theo cáo trạng, ông Phan Thế Thượng (64 tuổi, ngụ Đồng Nai) biết rõ tàu kéo SG-3745 không đảm bảo an toàn kỹ thuật, biết Trần Văn Giang (37 tuổi, ngụ Sóc Trăng) không có bằng lái, nhưng vẫn giao cho Giang điều khiển tàu kéo SG-3745 đẩy sà lan SG-5984 chở cát từ Trà Vinh về Đồng Nai. Khoảng 11 giờ 30 phút ngày 20-3-2016, khi đến khu vực cầu Ghềnh trên sông Đồng Nai (thuộc tỉnh Đồng Nai), Giang đã để sà lan va chạm vào trụ cầu Ghềnh lịch sử khiến sập cầu, dẫn đến đường sắt Bắc – Nam tê liệt, gây thiệt hại nặng. Ông Thượng bị VKSND TP Biên Hòa truy tố hai tội “Đưa vào sử dụng các phương tiện giao thông đường thủy không đảm bảo an toàn” và “Giao cho người không đủ điều kiện điều khiển các phương tiện giao thông đường thủy”. Ông Giang bị truy tố về tội “Vi phạm quy định về điều khiển phương tiện giao thông đường thủy”.
Tại phiên tòa ngày 28/3, sau nửa ngày thực hiện phần xét hỏi, HĐXX đã hội ý và quyết định kết thúc ngày làm việc, cho biết sẽ dành thời gian để xem xét lại các vấn đề thủ tục thẩm định giá, xác định thiệt hại và vấn đề thay đổi biện pháp ngăn chặn đối với hai bị cáo vì đã hết thời hiệu quy định tạm giam. Phiên tòa tiếp tục vào sáng 29/3.