Theo đó, các ngành, đơn vị, địa phương phải kiểm soát chặt chẽ các nguồn xả thải trên địa bàn tỉnh, đặc biệt là những nguồn xả thải lớn (trên 200 m3/ngày đêm), xả thải trực tiếp ra lưu vực sông. Kiểm tra các điểm tập kết chất thải rắn, đề xuất phương án xử lý toàn bộ chất thải rắn trên địa bàn để đảm bảo chấm dứt tình trạng thải chất thải rắn bừa bãi gây ô nhiễm môi trường. Đề xuất phương án lắp đặt hệ thống quan trắc chất lượng nước tự động trên hệ thống sông Đáy thuộc địa phận tỉnh, đồng thời xây dựng phần mềm cơ sở dữ liệu quan trắc chất lượng nước mặt, nước thải, hoạt động xả nước thải của các cơ sở xả thải và cơ chế quản lý sử dụng phần mềm. Nghiên cứu lập danh mục nguồn nước nội tỉnh, trong đó xác định rõ các nguồn nước nội tỉnh trên lưu vực sông Nhuệ - Đáy. Tổ chức xác định, cắm mốc hành lang bảo vệ nguồn nước theo quy định của pháp luật về tài nguyên nước.
Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chủ trì phối hợp với các đơn vị có liên quan có biện pháp chặt chẽ kiểm soát nước thải, chất thải trong sản xuất nông nghiệp để giảm thiểu ô nhiễm nguồn nước trong các kênh, mương tưới tiêu thủy lợi trên địa bàn tỉnh.
Sở Công Công thương, Ban Quản lý các KCN tỉnh đôn đốc, đẩy nhanh tiến độ đầu tư, xây dựng đưa vào vận hành các công trình xử lý nước thải tập trung tại các KCN, CCN làng nghề trên địa bàn tỉnh để xử lý nước thải trước khi ra môi trường đáp ứng được yêu cầu về quy chuẩn kỹ thuật cho. Đồng thời, tăng cường kiểm tra, giám sát việc chấp hành pháp luật về BVMT đối với các cơ sở sản xuất, kinh doanh trong các KCN, CCN, làng nghề và xử lý nghiêm theo quy định nếu phát hiện trường hợp vi phạm về BVMT.
Ngoài ra, UBND các huyện, thành phố phối hợp với các đơn vị có liên quan tăng cường kiểm tra việc chấp hành pháp luật về BVMT tại các khu đô thị, khu dân cư tập trung; các cơ sở sản xuất, kinh doanh dịch vụ thuộc thẩm quyền; làng nghề có hoạt động xả thải trên địa bàn, đồng thời xử lý nghiêm theo quy định nếu phát hiện trường hợp vi phạm về BVMT. Tổ chức thu gom, xử lý toàn bộ chất thải rắn phát sinh; chấm dứt và xử lý nghiêm tình trạng chất thải vứt bừa bãi, gây ô nhiễm môi trường. Cùng với đó, đề xuất xây dựng cơ chế, chính sách khuyến khích, hỗ trợ các cơ sở sản xuất, kinh doanh, dịch vụ, hộ gia đình trong làng nghề di dời hoạt động vào các KCN, CCN.
